На территории республики расположена основная часть Кавказского заповедника с его горными хребтам, расчлененные глубокими долинами и пещерами. Вершины гор покрыты снежниками и ледниками. Все реки Адыгеи относятся к бассейну Кубани: Лаба, Белая, Чохрак, Фарс, Пшиш, Псекупе и др. На территории республики водохранилища: Краснодарское, Тщикское, Шапсугское, Октябрьское. В низовьях некоторых рек плавни. Леса занимают почти 40 % территории и расположены они главным образом в горной части республики. Преобладает дуб, бук, граб, клен, ясень и другие широколиственные породы деревьев с обилием подлеска. Много дикорастущих плодово-ягодных деревьев и кустарников.