Подольский район расположен на юго-востоке от г. Москвы на расстоянии около 9 км. Площадь Подольского района в Московской области составляет 106254 га (1 тыс. 60 кв. км). Граничит с Ленинским, Домодедовским, Чеховским, Наро-Фоминским районами, а также с Калужской областью и административной границей Москвы. В пределах территории Подольского района, но не входящими в его состав, находятся города Подольск, Климовск, Щербинка и Троицк. На территории Подольского района расположено 219 населенных пунктов, в которых проживает 78.2 тыс. человек.
Административный центр – город Подольск. Расположен на Окско-Москворецкой равнине, на р. Пахра (приток р. Москва), в 43 км к югу от Москвы.
Рельеф района равнинный, хоть и не плоский, с перепадом высот примерно 115 м, что является средней величиной для Подмосковья. Около половины территории занимают большие лесные массивы. В районе расположены 1 комплексный и 6 ботанических государственных природных заказников, на их территории охраняется целый ряд ценных объектов живой природы, включающий уникальные участки широколиственных и хвойно-широколиственных лесов, редкие виды растений и животных.